Ministerstwo Rolnictwa i Rozwoju Wsi odpowiada za utworzenie i utrzymanie Krajowej Sieci Obszarów Wiejskich. Struktura KSOW ma charakter dwupoziomowy tzn. posiada Jednostkę Centralną (Sekretariat Centralny) i 16 Jednostek Regionalnych (Sekretariatów Regionalnych).
Sekretariat Centralny KSOW tworzy się w MRiRW. Sekretariat Centralny odpowiada m. in. za:

• koordynację prac KSOW, w tym wspieranie Sekretariatów Regionalnych i zapewnienie aktywizacji w celu realizacji zadań;
• ułatwianie kontaktu pomiędzy członkami Sieci;
• koordynację stworzenia i prowadzenia portalu internetowego Sieci;
• utrzymanie kontaktów z Europejska Siecią Obszarów Wiejskich.

Sekretariaty Regionalne tworzy się w Urzędach Marszałkowskich. Podstawą działania Sekretariatów Regionalnych jest Plan Działania. Sekretariaty Regionalne wspierają realizacje zadań KSOW, ułatwiają kontakty między członkami Sieci w danym regionie oraz współpracę między regionami.